Secondo la Convenzione tra la Confederazione e i Cantoni universitari sulla cooperazione nel settore universitario del 4 dicembre 2000 la Conferenza Universitaria Svizzera può emanare delle direttive in ambiti precisi. Finora ha emanato le direttive seguenti:

• Direttive per l'accreditamento nel settore universitario in Svizzera , del 28 giugno 2007 (in vigore il 1.9.2007)
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• Direttive per l'accreditamento nel settore universitario in Svizzera , del 16 ottobre 2003 (abrogato il 31.8.2007)
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• Direttive per il rinnovamento coordinato dell'insegnamento nelle università svizzere nell'ambito del processo di Bologna (Direttive di Bologna) del 4 dicembre 2003 con commento, 3. edizione, stato al 1. agosto 2008
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• La Conferenza dei Rettori delle Università Svizzere (CRUS) ha emanato altri regolamenti in relazione al processo di Bologna (tedesco e francese)

• Direttive per la garanzia della qualità delle istituzioni universitarie svizzere (Direttive per la garanzia della qualità) del 7 dicembre 2006 (con spiegazioni)
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